Василий Иванович Колчак родился в начале 1837 года в городе Одесса. В метрической книге Соборной Преображенской церкви Одессы за 1837 год сохранилась запись, свидетельствующая, что в январе «первого числа у титулярного советника, служащего в Одесском уездном суде, Ивана Лукьянова – сына Колчака и законной жены его Екатерины Авксентьевны, дочери урожденной Баркаревой, родился сын Василий. Воспитывался в Одесской Ришельевской гимназии, где в те годы были еще живы традиции основавших ее французских эмигрантов. Хорошо знал французский язык и любил все французское, хотя именно с французами ему вскоре пришлось воевать».
В 17-летнем возрасте Василий Иванович поступил на службу в морскую артиллерию Черноморского флота в звании кондуктора (младший офицерский чин). Ему поручили конвоировать транспорт пороха из Николаева в Севастополь. Доставив опасный груз в осажденную крепость, юноша там и остался. Вчерашний гимназист попал в самое пекло – на Малахов Курган.
Война
С 15 апреля по 27 мая 1855 года Василий Иванович состоял помощником командира батареи, прикрывавшей гласис – пологую насыпь впереди наружного рва, с уклоном в сторону противника. «Наблюдение за правильностью стрельбы и исправностью земляного бруствера у амбразур; снабжение каждого орудия потребным количеством снарядов и зарядов; ежедневный отчет в убыли прислуги да требование новой и размещение ее по орудиям – вот, изо дня в день, мои занятия на батарее, – вспоминал он впоследствии. – Как я остался цел, и до сих пор понять не могу». 27 мая его контузило осколком бомбы. Несколько дней пролежал в госпитале, а 5 июня вернулся на тот же гласис, теперь уже как бывалый воин.
4 августа того же года за сожжение фашин и туров, приготовленных французами для заложения ложементов перед гласисной батареей на Малаховом Кургане, награжден знаком отличия Военного ордена (солдатский «Георгий»).
Севастополь держался, пока держался Малахов курган. 27 августа 1855 года тяжело раненый Василий Иванович, оказавшийся одним из семерых выживших защитников Каменной башни на Малаховом Кургане, был взят в плен французами и отправлен на Принцевы острова в Мраморное море.
После войны Василию Ивановичу легко далась бы военная карьера, но прапорщик Колчак стал студентом столичного Горного института, факультета металлургии. Получив специальность горного инженера, работал на Златоустовском заводе на Урале. Изучал металлургическое и оружейное дело.
Затем вернулся в Петербург и 1865 году поступил на службу на Обуховский сталелитейный завод. Василий Иванович почти 30 лет служил представителем Адмиралтейского ведомства по приемке орудий и снарядов на Обуховском заводе, медленно рос в чинах, и генерал-майора получил вместе с отставкой в 1889 году. Продолжал служить на Обуховском заводе до 1899 года, заведовал сталепудлинговой мастерской, издавал научные и исторические труды.
Скончался 4 апреля 1913 года в Санкт-Петербурге.